1. Не работает DKIM.
2. Разные заголовки при отправке через PHP и ISPManager webmail.

exim.con то что менялfbegin transports
DKIM_DOMAIN = ${lc:${domain:$h_from:}}
DKIM_FILE = /etc/exim/dkim/${lc:${domain:$h_from:}}.pem
DKIM_PRIVATE_KEY = ${if exists{DKIM_FILE}{DKIM_FILE}{0}}
remote_smtp:
driver = smtp

.ifdef DKIM_ENABLE
dkim_domain = DKIM_DOMAIN
dkim_selector = mail
dkim_private_key = DKIM_PRIVATE_KEY
dkim_canon = relaxed
dkim_strict = 0
.endif